Как отформатировать и сравнить ввод с bash/vm?

Я работаю над настольным приложением, которое будет анализировать некоторые вещи на виртуальной машине. Я могу писать и читать после SSH соединения. Я сохраняю ввод во временном .txt файле. Теперь я хочу сравнить его, скажем, с другим .txt файлом, который содержит правильные amount/name каталогов. Например, если я хочу проверить каталоги на ../workspace/ с помощью приведенного ниже кода из scanForVm. Содержимое (на самом деле не только вывод команды) сохраняется в файл .txt.

У меня проблема в том, что он записывает в него какие-то ненужные вещи, и я не могу сравнить его с другим моим .txt файлом.

Я пытался найти ответ уже несколько часов и пробовал разные подходы.

public void scanForVm(MouseEvent event) throws IOException, InterruptedException {
    if (event.getSource() == scanButton) {

        networkCheck.scanNetwork();
        sshConnection.connectionToSsh("ls -d workspace/*/\n");
        sshConnection.readOutput();
    }

}

а потом:

public void readOutput() throws IOException, InterruptedException {

    Path file = Paths.get(" / path / To / Text.txt ");

    System.out.println(outputDescr); //Debug format
    InputStream stdout = new StreamGobbler(sess.getStdout());
    ByteArrayOutputStream result = new ByteArrayOutputStream();
    byte[] buffer = new byte[1024];
    int read;
    String output = "";

    while ((read = stdout.read(buffer)) != -1) {
        result.write(buffer, 0, read);
        Files.write(file, buffer);
        Thread.sleep(2000);
        System.out.println(output);
    }
}

Я хочу, чтобы ввод из виртуальной машины был действительно читаемым.

Теперь я получаю это:

Добавлена ​​идентификация:

/path/path/path/.ssh/...
[0m[01;36mworkspace/directory/[0m                 [01;36mworkspace/directory2/[0m  
ls -d workspace/*/

И я хочу, чтобы это было только:

workspace/directory/
workspace/directory2/