Как мне перевести что-то подобное в SQLAlchemy?
select x - y as difference...
Я умею делать:
x.label('foo')
... но я не уверен, где разместить вызов метода ".label ()" ниже:
select ([table.c.x - table.c.y], ...






Метод ColumnElement - всего лишь помощник; метка() можно использовать следующим образом:
select([sql.expression.label('foo', table.c.x - table.c.y), ...])