Как программно вставить сгенерированные извне изображения в уценку R?

Вместо того, чтобы включать относительный путь к изображению следующим образом:

![\label{fig:R1amb}R1 Ambient RNA Contamination](../outs/pre-processing/ambientRNA_R1.png)

Я хотел бы получить изображение из объекта yaml следующим образом:

![\label{fig:R1amb}R1 Ambient RNA Contamination](`r yaml$inputs$R1_ambient`)

где yaml$inputs$R1_ambient содержит полный путь к png. Однако это не отображает изображение. Это почему?

r r-markdown knitr

04.04.2022 17:41

Стоит ли изучать PHP в 2026-2027 годах?

Привет всем, сегодня я хочу высказать свои соображения по поводу вопроса, который я уже много раз получал в своем сообществе: "Стоит ли изучать PHP в...

Поведение ключевого слова "this" в стрелочной функции в сравнении с нормальной функцией

В JavaScript одним из самых запутанных понятий является поведение ключевого слова "this" в стрелочной и обычной функциях.

Приемы CSS-макетирования - floats и Flexbox

Здравствуйте, друзья-студенты! Готовы совершенствовать свои навыки веб-дизайна? Сегодня в нашем путешествии мы рассмотрим приемы CSS-верстки - в...

Тестирование функциональных ngrx-эффектов в Angular 16 с помощью Jest

В системе управления состояниями ngrx, совместимой с Angular 16, появились функциональные эффекты. Это здорово и делает код определенно легче для...

Концепция локализации и ее применение в приложениях React ⚡️

Локализация - это процесс адаптации приложения к различным языкам и культурным требованиям. Это позволяет пользователям получить опыт, соответствующий...

Пользовательский скаляр GraphQL

Листовые узлы системы типов GraphQL называются скалярами. Достигнув скалярного типа, невозможно спуститься дальше по иерархии типов. Скалярный тип...

Перейти к ответу Данный вопрос помечен как решенный

Ответы 1

Ответ принят как подходящий

Я не уверен, какой вариант Rmarkdown вы используете (поэтому не уверен насчет yaml$inputs и перекрестной ссылки на ярлык). Тем не менее, мое решение должно работать.

Вы можете использовать knitr::include_graphics в чанке R, чтобы использовать параметризованный путь:

---
title: "Test"
date: "4/4/2022"
output: html_document
params:
  R1_ambient: "test.png"
---

```{r setup, include=FALSE}
knitr::opts_chunk$set(echo = TRUE)
```

# Plot
```{r R1amb, echo = FALSE, fig.cap = "R1 Ambient RNA Contamination"}
knitr::include_graphics(params$R1_ambient)
```

Я вижу, мне не приходило в голову определять переменные в заголовке таким образом (кроме нескольких . Я читал в отдельном файле и присваивал его yaml. Это все еще может работать потенциально. Посмотрим. Спасибо за ваше помощь.

— 04.04.2022 20:23

Я понимаю. Я думаю, не должно быть проблем с использованием вашего подхода вместо include_graphics, однако параметры yaml точно рассчитаны на этот вариант использования.

— 05.04.2022 11:36

04.04.2022 19:01