Как распаковать строку в кодировке base64 в R?

Цель

Цель состоит в том, чтобы сделать конфигурацию и код читаемыми после того, как они были экспортированы из приложения, которое хранит эти данные в кодировке base64 и формате gzip.

Тест в Linux-оболочке

Пример строки с кодом

"H4sIAAAAAAAAAIWSS0vEMBSF9/0VIYvubHUnNGlhfIDCwOCMuCyhTeOVTBLzGPTfmzY60yKju+Tc8N1z7o2RQYBqmTESuGthaDuHXJpWTRknzsZfowK0DrSi+Ki4x4qrTPShB8fPu/uIaN3VGVsGB4s49BcnrDKGjsJlwaF5P0sMtxY/swLadBeN/6jda9eBjrxfwrytQvcMjLgI3zLI999FJEuYSGmHpNdp9Gk7xWyQXkilRbL2NXnGdS18twuTvQfsqJkqHU6x0n7KlY5MLX2UjYOyxZqacBFIeDZyxdGettusYiwn+h7X/QadBnadY7oNVaGDS8eoXciZMAyTlckNxh+Vyid//4Qv+y3JeLwIAAA= = "

Декодируется и архивируется в оболочке Linux с помощью команды:

echo $1 | base64 -d | gunzip -c

Что приводит к:

plugin_applies_if_config<split>plugin_config=<?xml version = "1.0" encoding = "UTF-8"?>
<BusinessRule>
  <BusinessPlugin BusinessRulePluginID = "JavaScriptBusinessConditionWithBinds">
    <Parameters>
      <Parameter ID = "Binds" Type = "java.lang.String">&lt;?xml version=&quot;1.0&quot; encoding=&quot;UTF-8&quot;?&gt;
&lt;BindMap/&gt;
</Parameter>
      <Parameter ID = "ErrorMessages" Type = "java.lang.String"></Parameter>
      <Parameter ID = "JavaScript" Type = "java.lang.String">return false;</Parameter>
    </Parameters>
  </BusinessPlugin>
</BusinessRule>
<split>

Задача выполнена. ...почти.

Превратить в R-скрипт

Так как у меня есть несколько сотен таких строк, я хочу выполнять в скрипте те же команды, что и в оболочке Linux. И поскольку я знаю только немного R, я попытался использовать R. Я успешно извлек строки из XML-документа, который был экспортирован из приложения, и превратил их во фрейм данных с идентификатором столбцов, именем и кодом.

Ниже приведен упрощенный пример, в котором я пытаюсь шаг за шагом воспроизвести команды Linux.

encoded = "H4sIAAAAAAAAAIWSS0vEMBSF9/0VIYvubHUnNGlhfIDCwOCMuCyhTeOVTBLzGPTfmzY60yKju+Tc8N1z7o2RQYBqmTESuGthaDutBhDERcHXJpWTRknzsZfowK0DrSi+Ki4x4qrTPShB8fPu/uIaN3VGVsGB4s49BcnrDKGjsJlwaF5P0sMtxY/swLadBeN/6jda9eBjrxfwrytQvcMjLgI3zLI999FJEuYSGmHpNdp9Gk7xWyQXkilRbL2NXnGdS18twuTvQfsqJkqHU6x0n7KlY5MLX2UjYOyxZqacBFIeDZyxdGettusYiwn+h7X/QadBnadY7oNVaGDS8eoXciZMAyTlckNxh+Vyid//4Qv+y3JeLwIAAA= = "

decoded = base64enc::base64decode(what=encoded)
# decoded = openssl::base64_decode(encoded)
# decoded = jsonlite::base64_dec(encoded)
# 3 times the same result

str(decoded)
# an array of raw-types. Maybe i need to convert to a string?
paste(decoded, collapse = "")

Не похоже на расшифрованные данные base64 в оболочке Linux, но давайте попробуем разархивировать...

decompressed <- 
  tryCatch({  
    memDecompress(from = paste(decoded, collapse = ""),
                  type = "gzip",
                  asChar = TRUE)
  },
  error = function(cond) {
    message(cond)
    return(NA)
  })
# fails with "internal error -3 in memDecompress(2)" 
(decompressed)

Очевидно, что ввод для «gzip» не соответствует ожиданиям. Это должна быть какая-то двоичная строка.

Но как туда добраться? Что я делаю неправильно? Спасибо за ваш совет!

Вы всегда можете использовать system с командой оболочки. Если вам нужно сделать это в R, вы можете попробовать записать необработанный объект в файл и посмотреть, является ли файл допустимым zip-архивом. Если это так, вы можете попробовать последний шаг - разархивировать... Удачи!

Karsten W. 09.04.2019 22:43
Стоит ли изучать PHP в 2023-2024 годах?
Стоит ли изучать PHP в 2023-2024 годах?
Привет всем, сегодня я хочу высказать свои соображения по поводу вопроса, который я уже много раз получал в своем сообществе: "Стоит ли изучать PHP в...
Поведение ключевого слова "this" в стрелочной функции в сравнении с нормальной функцией
Поведение ключевого слова "this" в стрелочной функции в сравнении с нормальной функцией
В JavaScript одним из самых запутанных понятий является поведение ключевого слова "this" в стрелочной и обычной функциях.
Приемы CSS-макетирования - floats и Flexbox
Приемы CSS-макетирования - floats и Flexbox
Здравствуйте, друзья-студенты! Готовы совершенствовать свои навыки веб-дизайна? Сегодня в нашем путешествии мы рассмотрим приемы CSS-верстки - в...
Тестирование функциональных ngrx-эффектов в Angular 16 с помощью Jest
В системе управления состояниями ngrx, совместимой с Angular 16, появились функциональные эффекты. Это здорово и делает код определенно легче для...
Концепция локализации и ее применение в приложениях React ⚡️
Концепция локализации и ее применение в приложениях React ⚡️
Локализация - это процесс адаптации приложения к различным языкам и культурным требованиям. Это позволяет пользователям получить опыт, соответствующий...
Пользовательский скаляр GraphQL
Пользовательский скаляр GraphQL
Листовые узлы системы типов GraphQL называются скалярами. Достигнув скалярного типа, невозможно спуститься дальше по иерархии типов. Скалярный тип...
6
1
1 584
1
Перейти к ответу Данный вопрос помечен как решенный

Ответы 1

Ответ принят как подходящий

Функция memDecompress была улучшена в версии R 4.0.0 для правильной работы. Теперь вы должны быть в состоянии сделать

memDecompress(base64enc::base64decode(what=encoded), "gzip", asChar=TRUE)

Предыдущие версии вызывали затруднения, поскольку игнорировали стандартные заголовки. Вот несколько слов о более старых версиях R. В основном мы создаем необработанный поток байтов, а затем используем gzcon для их распаковки.

con <- rawConnection(base64enc::base64decode(what=encoded))
readLines(gzcon(con))
close(con)

Вы получите предупреждение о том, что есть «неполная последняя строка», но это только потому, что похоже, что в конце файла не было новой строки. В противном случае данные кажутся прекрасными.

См. также: stackoverflow.com/questions/39707388/…

MrFlick 09.04.2019 22:56

Я превратил ваши 3 строки кода в функцию, добавил try-catch, чтобы избавиться от предупреждения, применил его к фрейму данных и получил читаемый код и конфигурацию! :) Спасибо!

Uden VH 09.04.2019 23:11

@MrFlick Мне понравился твой ответ здесь, потому что ты мне очень помог. Огромное спасибо

Learner 10.04.2019 17:52

Другие вопросы по теме