Как я могу использовать вывод glmer для ввода rma.glmm в метаанализе логистической регрессии смешанной модели?

У меня есть несколько исследований, которые анализируются как смешанные модели с биномиальными результатами, и я пытаюсь провести метаанализ этих исследований. Например, в одном исследовании используется такой анализ:

glmer(outcome ~ condition + (1|ID) + (1|week), data = d, family=binomial)

Я считаю, что для проведения метаанализа мне нужно запустить функцию rma.glmm() в пакете metafor. rma.glmm() требует указания параметров ai, bi, ci и di (табличные данные 2x2), однако вывод glmer дает только yi; кажется нелогичным использовать фактические описания данных (игнорируя всю кластеризацию) для заполнения этих аргументов. Можно ли сгенерировать данные таблицы 2x2 подсчета из смешанной модели?

Или можно провести метаанализ с величиной эффекта и дисперсией и без таблицы 2x2? Из того, что я нашел, это выглядит возможным для rma.uni() (для линейных моделей), но не для обобщенных смешанных моделей.

Крошечное подмножество данных и анализа:

d <- structure(list(ID = c("634", "d06", "593", "f6a", "288", "d6a", 
"35e", "e19", "97c", "537", "28e", "f4a", "503", "dc4", "1a2", 
"c14", "142", "f74", "b7f", "cf7", "ec8", "19e", "ba5", "baa", 
"9f6", "4ac", "326", "975", "0fc", "a1d", "fd4", "ab6", "8dc", 
"35d", "11f", "52e", "416", "b74", "fef", "6d1", "151", "a37", 
"070", "364", "773", "22a", "6dc", "b4e", "16e", "5a3", "fba", 
"21a", "d24", "b3b", "979", "9bc", "d51", "d62", "1dc", "d7f", 
"7de", "e59", "f0e", "70c", "ef5", "275", "c77", "103", "db7", 
"4c3", "c26", "0c2", "bda", "726", "9ac", "645", "0fd", "dd7", 
"8d2", "1da", "525", "c5f", "bc7", "caf", "fbb", "034", "adc", 
"f3e", "2c2", "8b8"), condition = structure(c(1L, 1L, 1L, 1L, 
1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 
1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 2L, 2L, 2L, 2L, 2L, 2L, 
2L, 2L, 2L, 2L, 2L, 2L, 2L, 2L, 2L, 2L, 2L, 2L, 2L, 2L, 2L, 2L, 
2L, 2L, 2L, 2L, 2L, 2L, 2L, 2L, 3L, 3L, 3L, 3L, 3L, 3L, 3L, 3L, 
3L, 3L, 3L, 3L, 3L, 3L, 3L, 3L, 3L, 3L, 3L, 3L, 3L, 3L, 3L, 3L, 
3L, 3L, 3L, 3L, 3L, 3L), .Label = c("Control", "Note", "Pre Intervention"
), class = "factor"), outcome = c(0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 
0L, 0L, 1L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 1L, 0L, 0L, 1L, 
0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 1L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 1L, 0L, 0L, 0L, 
0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 1L, 0L, 1L, 0L, 0L, 1L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 
1L, 0L, 0L, 0L, 1L, 1L, 0L, 0L, 0L, 0L, 1L, 0L, 1L, 0L, 0L, 0L, 
0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 1L, 0L, 0L, 
0L, 0L, 0L), week = structure(c(27L, 26L, 26L, 27L, 29L, 25L, 
27L, 27L, 27L, 26L, 25L, 25L, 26L, 26L, 25L, 28L, 26L, 26L, 28L, 
28L, 26L, 27L, 25L, 27L, 27L, 25L, 27L, 28L, 26L, 25L, 28L, 29L, 
27L, 30L, 25L, 30L, 28L, 25L, 30L, 30L, 27L, 26L, 26L, 28L, 28L, 
27L, 27L, 28L, 28L, 26L, 25L, 28L, 27L, 26L, 25L, 27L, 29L, 26L, 
30L, 28L, 21L, 22L, 16L, 18L, 5L, 15L, 24L, 7L, 8L, 5L, 17L, 
19L, 12L, 6L, 9L, 14L, 10L, 13L, 2L, 3L, 3L, 15L, 11L, 20L, 1L, 
4L, 23L, 8L, 16L, 12L), .Label = c("2017-14", "2017-18", "2017-20", 
"2017-21", "2017-29", "2017-38", "2017-39", "2017-44", "2017-45", 
"2017-46", "2017-48", "2017-49", "2018-02", "2018-04", "2018-05", 
"2018-06", "2018-07", "2018-08", "2018-09", "2018-10", "2018-11", 
"2018-12", "2018-14", "2018-16", "2018-18", "2018-19", "2018-20", 
"2018-21", "2018-22", "2018-23"), class = "factor")), row.names = c(NA, 
-90L), class = "data.frame")
library(lme4)

library(metafor)

summary(glmer(outcome ~ condition + (1|ID) + (1|week), data = d, family=binomial)) 

Поздравляем с вашей первой публикацией в стеке и с добавлением данных! На данный момент сложно ответить на этот вопрос, потому что он задает много вопросов одновременно. Попробуйте сфокусировать сообщение и разместить вопросы между разделами кода, которые закрепляют то, о чем вы спрашиваете. Это сделает ваш вопрос более ясным и гарантирует, что вы получите полезный и своевременный ответ. Чтобы ответить на такой сложный вопрос, может потребоваться несколько сообщений.

Joe 31.01.2019 04:59
Стоит ли изучать PHP в 2026-2027 годах?
Стоит ли изучать PHP в 2026-2027 годах?
Привет всем, сегодня я хочу высказать свои соображения по поводу вопроса, который я уже много раз получал в своем сообществе: "Стоит ли изучать PHP в...
Поведение ключевого слова "this" в стрелочной функции в сравнении с нормальной функцией
Поведение ключевого слова "this" в стрелочной функции в сравнении с нормальной функцией
В JavaScript одним из самых запутанных понятий является поведение ключевого слова "this" в стрелочной и обычной функциях.
Приемы CSS-макетирования - floats и Flexbox
Приемы CSS-макетирования - floats и Flexbox
Здравствуйте, друзья-студенты! Готовы совершенствовать свои навыки веб-дизайна? Сегодня в нашем путешествии мы рассмотрим приемы CSS-верстки - в...
Тестирование функциональных ngrx-эффектов в Angular 16 с помощью Jest
В системе управления состояниями ngrx, совместимой с Angular 16, появились функциональные эффекты. Это здорово и делает код определенно легче для...
Концепция локализации и ее применение в приложениях React ⚡️
Концепция локализации и ее применение в приложениях React ⚡️
Локализация - это процесс адаптации приложения к различным языкам и культурным требованиям. Это позволяет пользователям получить опыт, соответствующий...
Пользовательский скаляр GraphQL
Пользовательский скаляр GraphQL
Листовые узлы системы типов GraphQL называются скалярами. Достигнув скалярного типа, невозможно спуститься дальше по иерархии типов. Скалярный тип...
2
1
141
0

Другие вопросы по теме