Как запустить файл .bat на сервере узла?

Вы можете использовать exec следующим образом

const { exec } = require('child_process');
exec('shutdown -s -t 0') ; // change command according to your system 

проверьте этот вопрос для получения более подробной информации о exec

Выполнение двоичного файла командной строки с помощью Node.js

Как правило, можно перезагрузить сервер в пакетном режиме, вызвав shutdown.exe.

Вы можете выполнить любой файл с помощью nodejs. Документация NodeJS — здесь.