Как заставить ggplot2 geom_bar отображать ось по уровням факторов, а не по сортировке по умолчанию

Я хотел бы сделать гистограмму в ggplot2 и сделать так, чтобы ggplot2 отображал мою ось X в том же порядке, что и в столбце Day44$Sample. Вот пример (мои реальные данные содержат 59 уровней факторов в столбце Day44$Sample.

Day44 <- data.frame(Sample = c(rep(6, 3), rep(8, 5), rep(12, 8), rep(100, 7), rep("41*", 3), rep("198*", 5)),
                Phylum = c(rep("Proteobacteria", 3), rep("Actinobacteria", 5), rep("Firmicutes", 8), 
                          rep("Chloroflexi", 7), rep("Cyanobacteria", 3), rep("Bacteroidetes", 5)), 
                Rel_Abund = c(rep(2.2, 3), rep(0.15, 5), rep(0.047, 8), rep(1.2, 7), rep(0.33, 3), rep(4.5, 5)))

Я читал, что для построения графика в том же порядке, что и мой столбец, я должен «сказать» ggplot2, что у меня уже есть упорядоченный фактор - на основе этого сообщения: Избегайте сортировки ggplot по оси x при построении графика geom_bar()

Вслед за постом:

Day44$Sample <- factor(Day44$Sample, levels = Day44$Sample)

когда я получаю следующую ошибку:

Error in levels<-(*tmp*, value = as.character(levels)) : factor level 2 is duplicated

Итак, я нашел этот пост: Предупреждение при определении фактора: повторяющиеся уровни в факторах устарели.

и следуя этому примеру (исключая sort, рекомендованный в посте, потому что мне не нужно его сортировать):

Day44$Sample <- factor(Day44$Sample, levels = unique(Day44$Sample)

который я затем рисую с:

ggplot() + geom_bar(aes(x = Sample, y = Rel_Abund, fill = Phylum), data = Day44, stat = 'identity')

И это дает мне хороший график, однако; ось x в любом случае отсортирована. Как заставить ggplot2 geom_bar отображать ось по уровням факторов, а не по сортировке по умолчанию

Этот фрагмент кода подсказывает мне ошибку, которая дает:

factor(unique(Day44$Sample))

6 8 12 100 41* 198*

Levels: 100 12 198* 41* 6 8

Как я могу изменить это так, чтобы мои уровни располагались в том же порядке, что и мои уникальные значения для Day44$Sample?

Я знаю, что могу вставить их вручную, вот так:

Day44$Sample <- factor(Day44$Sample, levels = c("6", "8", "12", "100", "41*", "198*"))

создание точного графика, который мне нужен, но это нецелесообразно, поскольку мои реальные данные имеют 59 уровней, и мне приходится делать это и с несколькими другими графиками. Я никогда не закончу делать это вручную.

Какие-либо предложения?

Стоит ли изучать PHP в 2026-2027 годах?
Стоит ли изучать PHP в 2026-2027 годах?
Привет всем, сегодня я хочу высказать свои соображения по поводу вопроса, который я уже много раз получал в своем сообществе: "Стоит ли изучать PHP в...
Поведение ключевого слова "this" в стрелочной функции в сравнении с нормальной функцией
Поведение ключевого слова "this" в стрелочной функции в сравнении с нормальной функцией
В JavaScript одним из самых запутанных понятий является поведение ключевого слова "this" в стрелочной и обычной функциях.
Приемы CSS-макетирования - floats и Flexbox
Приемы CSS-макетирования - floats и Flexbox
Здравствуйте, друзья-студенты! Готовы совершенствовать свои навыки веб-дизайна? Сегодня в нашем путешествии мы рассмотрим приемы CSS-верстки - в...
Тестирование функциональных ngrx-эффектов в Angular 16 с помощью Jest
В системе управления состояниями ngrx, совместимой с Angular 16, появились функциональные эффекты. Это здорово и делает код определенно легче для...
Концепция локализации и ее применение в приложениях React ⚡️
Концепция локализации и ее применение в приложениях React ⚡️
Локализация - это процесс адаптации приложения к различным языкам и культурным требованиям. Это позволяет пользователям получить опыт, соответствующий...
Пользовательский скаляр GraphQL
Пользовательский скаляр GraphQL
Листовые узлы системы типов GraphQL называются скалярами. Достигнув скалярного типа, невозможно спуститься дальше по иерархии типов. Скалярный тип...
1
0
699
1
Перейти к ответу Данный вопрос помечен как решенный

Ответы 1

Ответ принят как подходящий

Если вы хотите упорядочить уровни факторов в соответствии с порядком их появления в фрейме данных, используйте forcats::fct_inorder:

Day44$Sample = forcats::fct_inorder(Day44$Sample)

Подумав об этом еще раз, Day44$Sample <- factor(Day44$Sample, levels = unique(Day44$Sample)) должно было сработать - возможно, стоит попробовать еще раз, чтобы еще раз проверить свое понимание.

Marius 08.07.2019 07:53

Спасибо за рекомендацию. Я установил пакет forcats и запустил код, и он работал прекрасно! Спасибо.

Purrsia 08.07.2019 08:01

Другие вопросы по теме