Modal сбрасывает счетчик обратно на 1

Во-первых, потому что у вас есть только один модальный (#myModal), и ваша кнопка всегда ссылается на (#myModal), так что всегда будет открываться первый модальный. Попробуйте решение #myModal{{ $loop->index }}.

Во-вторых, вы можете использовать $ loop-> iteration вместо $ counter в цикле foreach.

Попробуй это.

<tbody>
@foreach ($guidelines as $guideline)
<tr>
    <td class = "text-center">{{ $counter }}</td>
    <td>{{ $guideline->description }}</td>
    <td>
        <a href = "/general-guidelines/{{ $guideline->id }}/edit" class = "btn btn-warning btn-sm"><i class = "far fa-edit"></i></a> 
        <button type = "button" class = "btn btn-danger btn-sm" data-toggle = "modal" data-target = "#myModal{{ $loop->index }}"><i class = "far fa-trash-alt"></i></button> 
        <div class = "modal fade" id = "myModal{{ $loop->index }}" role = "dialog">
            <div class = "modal-dialog modal-sm">
                <div class = "modal-content">
                    <div class = "modal-header">
                        <h4 class = "modal-title">Confirm Delete</h4>
                    </div>

                    <div class = "modal-body">
                        <p>Are you sure you want to delete this?</p>
                    </div>

                    <div class = "modal-footer">
                        <a href = "/general-guidelines/{{ $guideline->id }}/delete" class = "btn btn-danger">Confirm</a>
                        <button type = "button" class = "btn btn-default" data-dismiss = "modal">Close</button>
                    </div>
                </div>
            </div>
        </div>
    </td>
</tr>
@endforeach

с циклом for создается несколько модальных окон, но для всех модальных окон, сгенерированных с помощью цикла for, нельзя использовать один и тот же идентификатор myModal. id должен быть уникальным.