Настройте Swashbuckle для игнорирования пространства имен в моделях

Вы должны иметь возможность определять пользовательские идентификаторы схемы либо через ISchemaFilter. или создайте свою собственную «стратегию идентификатора схемы»: Настройка идентификаторов схемы

services.AddSwaggerGen(c =>
{
    ...
    c.CustomSchemaIds((type) => type.FullName);
};

Вы можете создать класс базовой модели, который содержит свойство имени (вспомните [JsonIgnore]), и используйте это свойство для стратегии.