Невозможно импортировать модули Python в rmarkdown

Я пытаюсь импортировать некоторые модули Python из созданного мной виртуального окружения в документе Rmarkdown. Я новичок в Python, поэтому я просто пройдусь по шагам моей настройки.

(1) Я создал новый виртуальный сервер под названием r-reticulate в корневом каталоге по умолчанию ~/.virtualenvs, используя

virtualenv -p /usr/bin/python3 r-reticulate

(2) После активации env я установил несколько модулей с помощью pip. Ниже приведен список установленных пакетов:

$ pip list

Package         Version
--------------- -------
cycler          0.10.0
kiwisolver      1.0.1
matplotlib      3.0.2
numpy           1.16.1
pandas          0.24.1
pip             19.0.3
pkg-resources   0.0.0
pyparsing       2.3.1
python-dateutil 2.8.0
pytz            2018.9
setuptools      40.8.0
six             1.12.0
virtualenv      16.4.1
wheel           0.33.1

(3) Теперь к моему коду R. У меня есть только 2 фрагмента кода. Первое:

```{r}
library(reticulate)
use_virtualenv(virtualenv = "r-reticulate")
```

и второй:

```{python}
import pandas as pd
import numpy as np
```

Первый фрагмент кода выполняется без ошибок, но второй возвращает:

ImportError: No module named matplotlib

Я убедился, что среда r-reticulate работает, активировав ее и импортировав эти модули через терминал.

Sesssion Info

R version 3.5.1 (2018-07-02)
Platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit)
Running under: Ubuntu 18.04.1 LTS

Matrix products: default
BLAS: /usr/lib/x86_64-linux-gnu/atlas/libblas.so.3.10.3
LAPACK: /usr/lib/x86_64-linux-gnu/atlas/liblapack.so.3.10.3

attached base packages:
[1] stats     graphics  grDevices utils     datasets  methods   base     

other attached packages:
[1] reticulate_1.10 ggplot2_3.1.0