Передача элементов массива из javascript в php

Я считаю, что ваша проблема заключается в этих двух строках:

lat = points[i][LAT];
lng = points[i][LNG];

Во-первых, вы определили их в глобальном масштабе. Они должны иметь префикс с ключевым словом var, если вы еще не определили эти переменные выше.

Во-вторых, [LAT] пытается использовать (я предполагаю, унифицированную) переменную с именем LAT. Правильный синтаксис для использования имени строкового ключа - points[i]['LAT'] или points[i].LAT.

Итак, обновив код до

var xmlhttp = new XMLHttpRequest();
var distancesObject = null;
var lat = points[i].LAT;
var lng = points[i].LNG;

Надеюсь, это решит вашу проблему.

вы перезаписываете объект, который обрабатывает соединение в цикле for, вероятно, быстрее, чем может вернуть ответ.

пытаться:

var xmlhttp = [];
    for(var i=0;i<points.length;++i){
            xmlhttp[i] = new XMLHttpRequest();
            var distancesObject = null;
            lat = points[i][LAT];
            lng = points[i][LNG];
            xmlhttp[i].onreadystatechange = function() {
            if (xmlhttp[i].readyState == 4 && xmlhttp[i].status == 200){
                if (xmlhttp[i].response!=null){
                    distancesObject = JSON.parse(xmlhttp.response); 
                }
            }       
        };  
            xmlhttp[i].open("GET", "Distances.php?lat = " + lat + "&lng = " + lng, true);  
            xmlhttp[i].send();
        }

Пожалуйста, не делай этого. Действительно. Добавьте все элементы массива в свой URL-адрес и выполните только запрос один, где вы запросите все, что вам нужно, и вернете список. Обработайте список в ответе. Что-то вроде (с макушки):

var urlParams = [];

points.forEach(function(point) {
    urlParams.push("lat[] = " + point.LAT + "&lng[] = " + point.LNG);
});

var xmlhttp = new XMLHttpRequest();
var distancesObject = null;

xmlhttp.onreadystatechange = function() {
    if (xmlhttp.readyState == 4 && xmlhttp.status == 200){
        if (xmlhttp.response!=null){
            distancesObject = JSON.parse(xmlhttp.response); 
        }
    }       
};  

xmlhttp.open("GET", "Distances.php?" + urlParams.join("&"), true);  
xmlhttp.send();

В PHP:

$whereClause = "";

for ($i = 0; $i < count($_GET['lat']); $i++) {
    $whereClause.= "(lat='" . $_GET['lat'][$i] . "' and lng='" . $_GET['lng'][$i]. "') and ";
}

$query = "SELECT pharmacyDistance, schoolDistance, restaurantDistance, busStationDistance FROM distances WHERE " . substr($whereClause, 0, (strlen($whereClause) - 4)); // Substr to remove last ' and' from where clause

$result = mysqli_query($dbc,$query);
$count = mysqli_num_rows($result);  
$distances = array();
while($row = mysqli_fetch_array($result, MYSQLI_ASSOC)) {
    $distances[] = $row;
}

$json_array = json_encode($distances);
if ($json_array!=null){
    echo $json_array;
}
mysqli_close($dbc);

Тогда у вас будет список ваших distances как json и только одно попадание в вашу базу данных. Кроме того, ваше приложение не может вызывать ajax в цикле for, оно будет открывать различные параллельные асинхронные запросы, беспорядок.

Примерно так будет выглядеть запрос:

SELECT ... FROM ... WHERE (lat='1' and lng='1') and (lat='2' and lng='2') and ...

Я не тестировал эти коды и какое-то время не играю с PHP, поэтому надеюсь, что с кодом все в порядке, простите за опечатки или синтаксические ошибки.