Передать аргумент в массив функций

Вы можете использовать понимание списков:

A = np.asarray([[f(1,2) for f in row] for row in J])

Это должно работать как для массивов numpy, так и для списка списков.

Я не думаю, что есть действительно чистый способ, но он достаточно чистый и работает:

import operator
import numpy as np

# create array of lambdas
a = np.array([[lambda x, y, i=i, j=j: x**i + y**j for i in range(4)] for j in range(4)])

# apply arguments 2 and 3 to all of them
np.vectorize(operator.methodcaller('__call__', 2, 3))(a)
# array([[ 2,  3,  5,  9],
#        [ 4,  5,  7, 11],
#        [10, 11, 13, 17],
#        [28, 29, 31, 35]])

Альтернативно и немного более гибко:

from types import FunctionType

np.vectorize(FunctionType.__call__)(a, 2, 3)
# array([[ 2,  3,  5,  9],
#        [ 4,  5,  7, 11],
#        [10, 11, 13, 17],
#        [28, 29, 31, 35]])