Проблемы с функцией суммирования различных элементов во вложенной структуре данных в R

Я пытаюсь создать простую функцию, как суммировать некоторые переменные во вложенном наборе данных.

Вот гораздо более простой пример

df <- data.frame(ID=c(1,1,1,1,2,3,3,4,4,4,5,6,7,7,7,7,7,7,7,7),
var=c("A","B","C","D","B","A","D","A","C","D","D","D","A","D","A","A","A","B","B","B"),
N=c(50,50,50,50,298,156,156,85,85,85,278,301,98,98,98,98,98,98,98,98))

Думайте об этом как о кадре данных, содержащем результаты 7 различных исследований. В каждом исследовании изучалась одна или несколько переменных (A, B, C, D). Переменные означают

ID = ID соответствующего исследования.

var = соответствующая переменная, измеренная в каждом исследовании. В некоторых исследованиях измерялась только одна переменная (например, ID=2, которая содержала только b), в некоторых — несколько.

N = размер выборки каждого исследования. То есть каждый ID имеет размер выборки

Я хотел бы создать функцию, которая суммирует три вещи:

k = количество исследований, в которых измерялась каждая переменная (например, «A»)

m = как часто измерялась каждая переменная (независимо от того, измерялась ли переменная в некоторых исследованиях более одного раза) — простая частота.

N = размер выборки для каждой переменной, но только один раз за исследование. То есть дублирование для каждого идентификатора исследования не допускается.

Моя текущая версия (я настоящий нуб, так что простите за форму) дает именно то, что я хочу:

  model    km   N
1     A 4 (7) 389
2     B 3 (5) 446
3     C 2 (2) 135
4     D 6 (6) 968

Например, переменная А измерялась 7 раз, но только в 4 исследованиях (т.е. в исследовании №7 она измерялась несколько раз. Размер (неизбыточной) выборки составил N=389 (не считая нескольких показателей исследования №7 более одного время).

(Примечание: круглые скобки в таблице полезны, так как я намерен скопировать результаты в документ)

Вот текущая версия кода. Проблемы начинаются с части, содержащей трубы

kmn <- function(data, x, ID, N) {
  m <-table(data[[x]]) 
  k <-apply(table(data[[x]],data[[ID]]), 1, function(x) length(x[x>0]) )
  model <- levels(data[[x]])
  km <- cbind(k,m)
  colnames(km)<-c("k","m")
  km <- paste0(k," (",m,")") 
  smpsize <- data %>% 
    group_by(data[[x]]) %>% 
    summarise(N = sum(N[!duplicated(ID)])) %>% 
    select(N)
  cbind(model,km,smpsize)  
}

kmn(data=df, x = "var", ID = "ID", N = "N")

Приведенный выше код работает, но только если df-dataframe действительно содержит N-переменную (но не с другим именем переменной). Я предполагаю, что «данные%>%» побуждают R заглянуть в фрейм данных и не использовать часть «сумма (N ...» в качестве ссылки на вызов.

Я могу догадаться, что это выглядит ужасно для кого-то с какой-то идеей :)

Спасибо за любые идеи Хольгер

Загляните в group_by и суммируйте функции из dplyr. Они очень удобны в вашем случае.

José Luiz Ferreira 04.07.2019 16:13
Стоит ли изучать PHP в 2026-2027 годах?
Стоит ли изучать PHP в 2026-2027 годах?
Привет всем, сегодня я хочу высказать свои соображения по поводу вопроса, который я уже много раз получал в своем сообществе: "Стоит ли изучать PHP в...
Поведение ключевого слова "this" в стрелочной функции в сравнении с нормальной функцией
Поведение ключевого слова "this" в стрелочной функции в сравнении с нормальной функцией
В JavaScript одним из самых запутанных понятий является поведение ключевого слова "this" в стрелочной и обычной функциях.
Приемы CSS-макетирования - floats и Flexbox
Приемы CSS-макетирования - floats и Flexbox
Здравствуйте, друзья-студенты! Готовы совершенствовать свои навыки веб-дизайна? Сегодня в нашем путешествии мы рассмотрим приемы CSS-верстки - в...
Тестирование функциональных ngrx-эффектов в Angular 16 с помощью Jest
В системе управления состояниями ngrx, совместимой с Angular 16, появились функциональные эффекты. Это здорово и делает код определенно легче для...
Концепция локализации и ее применение в приложениях React ⚡️
Концепция локализации и ее применение в приложениях React ⚡️
Локализация - это процесс адаптации приложения к различным языкам и культурным требованиям. Это позволяет пользователям получить опыт, соответствующий...
Пользовательский скаляр GraphQL
Пользовательский скаляр GraphQL
Листовые узлы системы типов GraphQL называются скалярами. Достигнув скалярного типа, невозможно спуститься дальше по иерархии типов. Скалярный тип...
0
1
46
2
Перейти к ответу Данный вопрос помечен как решенный

Ответы 2

Ответ принят как подходящий

Сначала удалите дубликаты с помощью функции unique и просуммируйте на var.

Во-вторых, возьмите df и сгруппируйте по var, n() дает количество и n_distinct(ID) количество уникальных идентификаторов, затем вы присоединяетесь к кадру данных stats_N

library(dplyr)

stats_N <- df %>% 
  select(ID,var,N) %>% 
  unique() %>% 
  group_by(var) %>% 
  summarise(N=sum(N))

df %>% 
  group_by(var) %>% 
  summarise(n=n(),km=n_distinct(ID)) %>% 
  left_join(stats_N)

# A tibble: 4 x 4
#  var       n    km     N
#  <fct> <int> <int> <dbl>
#1 A         7     4   389
#2 B         5     3   446
#3 C         2     2   135
#4 D         6     6   968

в дополнение к ответу @fmarm, это также можно сделать без объединения, где сделать группу с помощью «var», получить количество различных элементов в «D» (n_distinct), количество строк (n()) и sum из недублированные 'N's

library(dplyr)
df %>% 
  group_by(model = var) %>%
  summarise(km = sprintf("%d (%d)", n_distinct(ID), n()), 
          N = sum(N[!duplicated(N)]))
# A tibble: 4 x 3
#  model km        N
#  <fct> <chr> <dbl>
#1 A     4 (7)   389
#2 B     3 (5)   446
#3 C     2 (2)   135
#4 D     6 (6)   968

Большое спасибо. Я абсолютно взволнован. Недавно я открыл для себя dplyr, но не знал, что он такой мощный. Однако я не понимаю большинство аргументов ("sprintf", "%d" и т. д.). У вас есть какая-то рекомендация, куда я мог бы перейти, чтобы узнать больше о возможностях?

HolgerSteinmetz 05.07.2019 08:10

@HolgerSteinmetz Я тоже рад, что тебе это нравится. sprintf — это базовая функция R, похожая на функцию в других языках (format или f string -python), где она возвращает результат при форматировании ввода на основе. здесь %d предполагает, что входным аргументом будет цифра. С %d (%d) он в основном меняет формат, добавляя () и вставляя два аргумента (n_distinct, n()) в одну строку. Я бы сначала почитал виньетки dplyr здесь

akrun 05.07.2019 08:17

Другие вопросы по теме