Python Api C генерирует утечку памяти

У меня есть этот простой код для запуска небольшого кода python в C:

Py_Initialize();

string_module = PyUnicode_FromString((char *) "kmer_counter");
module = PyImport_Import(string_module);
function = PyObject_GetAttrString(module, (char *) "counter");
result = PyObject_CallFunction(function, "i", 5);

if ( !result ) {
    fprintf(stderr, "Exception:\n");
    PyErr_PrintEx(0);
    exit(1);
}

Py_DECREF(string_module);
Py_DECREF(module);
Py_DECREF(function);
Py_DECREF(result);

Py_Finalize();

Я тестирую код с помощью valgrind, и у меня есть утечка памяти (здесь выход). После некоторого теста я обнаружил, что утечки памяти вызваны инструкцией Py_Initialize();. Как я могу решить эту проблему?

Я запускаю valgrind с этим флагом:

valgrind --tool=memcheck --leak-check=full ./exe

можете ли вы проверить более новую версию python (например, python 3.7?), чтобы увидеть, сохраняется ли проблема?

Jean-François Fabre 28.04.2019 15:39

@ Jean-FrançoisFabre Как мне это указать?

th3g3ntl3man 29.04.2019 21:52

установить новую версию питона. Вывод показывает, что вы используете 2.7

Jean-François Fabre 29.04.2019 21:52

@Jean-FrançoisFabre Я установил python3.7, но если я использую этот флаг -I/usr/include/python3.7 -lpython3.7, он не находит библиотеку

th3g3ntl3man 29.04.2019 21:59

это -lpython37 наверное. И -I для компиляции включает, нужен путь ссылки -L

Jean-François Fabre 29.04.2019 22:02

@Jean-FrançoisFabre Я пытаюсь использовать ваши предложения, но это ошибка: ld: warning: directory not found for option '-L/usr/include/python3.7' ld: library not found for -lpython37

th3g3ntl3man 29.04.2019 22:05
-L нужен каталог существующий, в котором находится библиотека, а не включение.
Jean-François Fabre 29.04.2019 22:06

@Jean-FrançoisFabre Как найти правильный путь к библиотеке для Linux и macOS?

th3g3ntl3man 29.04.2019 22:08
Почему в Python есть оператор "pass"?
Почему в Python есть оператор "pass"?
Оператор pass в Python - это простая концепция, которую могут быстро освоить даже новички без опыта программирования.
Некоторые методы, о которых вы не знали, что они существуют в Python
Некоторые методы, о которых вы не знали, что они существуют в Python
Python - самый известный и самый простой в изучении язык в наши дни. Имея широкий спектр применения в области машинного обучения, Data Science,...
Основы Python Часть I
Основы Python Часть I
Вы когда-нибудь задумывались, почему в программах на Python вы видите приведенный ниже код?
LeetCode - 1579. Удаление максимального числа ребер для сохранения полной проходимости графа
LeetCode - 1579. Удаление максимального числа ребер для сохранения полной проходимости графа
Алиса и Боб имеют неориентированный граф из n узлов и трех типов ребер:
Оптимизация кода с помощью тернарного оператора Python
Оптимизация кода с помощью тернарного оператора Python
И последнее, что мы хотели бы показать вам, прежде чем двигаться дальше, это
Советы по эффективной веб-разработке с помощью Python
Советы по эффективной веб-разработке с помощью Python
Как веб-разработчик, Python может стать мощным инструментом для создания эффективных и масштабируемых веб-приложений.
0
8
248
1
Перейти к ответу Данный вопрос помечен как решенный

Ответы 1

Ответ принят как подходящий

Выделенный вами вывод (в основном) не утечка памяти, а скорее неверное чтение. Скорее всего, они вызваны особым образом python управляет своей памятью.

В составе исходных файлов Python вы должны найти файл подавления для valgrind, это должно подавить эти сообщения, так как они не являются реальными ошибками.

Для моей версии Python 3.6.6 он находится в Python-3.6.6/Misc/valgrind-python.supp.

Итак, запустите свою программу под valgrind, используя: valgrind --suppressions=path/to/the/python/Misc/valgrind-python.supp

Вам также может сначала понадобиться сделать: экспортировать PYTHONMALLOC=malloc

Другие вопросы по теме