R : нижний индекс выходит за пределы

Я должен реализовать алгоритм Кохонена в измерении 4 * 4. Это работает, но у меня есть небольшая проблема, потому что я получаю эту ошибку:

######################################
## Initialize random matrix phi/psi ##
######################################

##Pour mac
setwd("/Users/amandinelecerfdefer/Desktop/Kohonen_MAP")
data_phipsi<-read.csv("/Users/amandinelecerfdefer/Desktop/Kohonen_MAP/pbA.txt.new.2.rep30.phipsi",h=F)

colnames(data_phipsi)<-c("phi1","psi2","phy2","psi3","phy3","psi4","phy4","psi5")

random_list<-list()
borne<-16 
for(n in 1:borne){
  random_list[[n]]<-floor(runif (8,min=-180,max=180)) 
}

# ##############Print random matrix#####
# for(n in 1:16){
#   print(random_list[[n]])
# }

#creation of a matrix 4*4 representing the Kohonen map containing the vectors of the angles phi/psi
Kohonen_matrix<-matrix(random_list,ncol=sqrt(borne),nrow=sqrt(borne))
rownames(Kohonen_matrix)<-c('1','2','3','4')
colnames(Kohonen_matrix)<-c('1','2','3','4')


#############################################
##Function for distance calculation (RMSDA)##
#############################################

RMSDA<-function(data_phipsi,Kohonen_matrix)
{
  difference<-data_phipsi-Kohonen_matrix 
  for(j in 1:length(difference)){
    if (difference[j]< -180) {difference[j]=difference[j]+360}
    if (difference[j]> +180) {difference[j]=difference[j]-360}
  }
  distance=mean(sqrt(difference^2))  
  return(distance) 
}

#######################
##LEARNING FUNCTION ##
#######################

learning<-function(initial_rate,iteration,data_phipsi){
  return(initial_rate/(1+(iteration/nrow(data_phipsi))))
}


##############################
## Program for Kohonen MAp ###
##############################

initial_rate=0.75 # Decrease with training time
initial_radius=2 # Decrease with training time
iteration=3   


for(step in 1:iteration)
{
  data_phipsi<-data_phipsi[sample(nrow(data_phipsi)),] # Sample vectors of training (samples of lines of the dataframe)
  print(step) #Visualize where we are in loops
  for(k_row in 1:nrow(data_phipsi))
  {
    #Update learn_rate and radius at each row of each iteration
    learn_rate<-learning(initial_rate,((step-1)*nrow(data_phipsi))+k_row,data_phipsi)
    learn_radius<-learning(initial_rate,((step-1)*nrow(data_phipsi))+k_row,data_phipsi)
    #Find distance between each vectors of angles of Kohonen Map and the training vector
    phipsi_RMSDA<-lapply(random_list, RMSDA, data_phipsi=data_phipsi[k_row,])


    #Unlist and create a matrix of distances
    vector_RMSDA<-unlist(phipsi_RMSDA)
    matrix_RMSDA<-matrix(vector_RMSDA,sqrt(borne),sqrt(borne))
    #Take the index of the winning neuron, it's the neuron that are more similar than the training vector
    win_index<-which(matrix_RMSDA==min(matrix_RMSDA), arr.ind=TRUE) 
    current_index<-list(c(1,1),c(2,1),c(3,1), c(4,1), c(1,2),c(2,2),c(3,2), c(4,2),c(1,3),c(2,3),c(3,3), c(4,3), c(1,4),c(2,4),c(3,4), c(4,4), c(1,4),c(2,4),c(3,4), c(4,4))



    #Update of angles of Kohonen Map vectors with the equation (be careful at number of parenthesis)
    for (mlist in 1:borne)
    {
       distance<-as.numeric(dist(rbind(win_index[1,], current_index[[mlist]])))
      random_list[[mlist]]<-(random_list[[mlist]]+ ( prot_phipsi[i_row,]-random_list[[mlist]])* (learn_rate*( exp (- ((distance)^2/(2*((learn_radius)^2)) )) ) ))
    }
    Kohonen_matrix<-matrix(random_list,sqrt(borne),sqrt(borne))
  } 
}

После запуска этого кода start я получаю сообщение об ошибке:

[1] 1 Error in win_index[1, ] : subscript out of bounds In addition: There were 16 warnings (use warnings() to see them)

Можете ли вы помочь мне решить это?

Спасибо. Спасибо.

Стоит ли изучать PHP в 2026-2027 годах?
Стоит ли изучать PHP в 2026-2027 годах?
Привет всем, сегодня я хочу высказать свои соображения по поводу вопроса, который я уже много раз получал в своем сообществе: "Стоит ли изучать PHP в...
Поведение ключевого слова "this" в стрелочной функции в сравнении с нормальной функцией
Поведение ключевого слова "this" в стрелочной функции в сравнении с нормальной функцией
В JavaScript одним из самых запутанных понятий является поведение ключевого слова "this" в стрелочной и обычной функциях.
Приемы CSS-макетирования - floats и Flexbox
Приемы CSS-макетирования - floats и Flexbox
Здравствуйте, друзья-студенты! Готовы совершенствовать свои навыки веб-дизайна? Сегодня в нашем путешествии мы рассмотрим приемы CSS-верстки - в...
Тестирование функциональных ngrx-эффектов в Angular 16 с помощью Jest
В системе управления состояниями ngrx, совместимой с Angular 16, появились функциональные эффекты. Это здорово и делает код определенно легче для...
Концепция локализации и ее применение в приложениях React ⚡️
Концепция локализации и ее применение в приложениях React ⚡️
Локализация - это процесс адаптации приложения к различным языкам и культурным требованиям. Это позволяет пользователям получить опыт, соответствующий...
Пользовательский скаляр GraphQL
Пользовательский скаляр GraphQL
Листовые узлы системы типов GraphQL называются скалярами. Достигнув скалярного типа, невозможно спуститься дальше по иерархии типов. Скалярный тип...
2
0
1 659
1

Ответы 1

Поскольку ошибка указывает, что индекс win_index[1,] выходит за пределы, это означает, что R не может получить доступ к элементу первой строки этой матрицы, поскольку он не существует. Вы должны дважды проверить, существует ли матрица на самом деле и была ли она инициирована, поскольку я не могу найти ее в приведенном вами фрагменте кода.

Если вы разместите правильный код, мы сможем лучше рассмотреть.

Кроме того, вы получаете другие предупреждения, которые могут не вызывать проблем. Если вы просто наберете warnings() в консоли R, вы увидите, что там происходит.

См. также Нижний индекс за пределами - общее определение и решение? для получения дополнительной информации.

Это лучше оставить в качестве комментария. В противном случае используйте доступный код и покажите, почему именно он не работает.

NelsonGon 16.02.2019 11:45

После тестирования моего кода я предполагаю, что функция lapply не выполняется правильно, потому что созданная таким образом матрица содержит только NA. И так как эта матрица используется позже, результат неверен, потому что NA присутствует во всей программе. Как можно исправить эту глупую ошибку? Спасибо. Спасибо.

Amandine Lecerf Defer 16.02.2019 17:51

вам нужно опубликовать воспроизводимый код с небольшим набором данных, сообщество может вам помочь. но, просто глядя на код, очень сложно понять, что происходит не так.

harryb 16.02.2019 21:38

Другие вопросы по теме