Регулярное выражение Bash для проверки расширений файлов

Я пытаюсь проверить тип данного файла, и если это то, что я ожидаю. Он может иметь одно из трех расширений .fa, .fasta или .fasta.gz. Глядя на другие вопросы, я думаю, что это должно быть довольно тривиально, однако, когда я пробую предложения, они не работают для меня.

Это то, что я пробовал, все из которых не совпадают:

#!/bin/bash

test1 = "abcdef.fa"
test2 = "ghijkl.fasta"
test3 = "mnopqr.fasta.gz"
echo "test1: $test1"
echo "test2: $test2"
echo "test3: $test3"

# Attempt 1
if [[ $test1 =~ *.fa|*.fasta|*.fasta.gz ]] &> /dev/null; then printf "Attempt1: Match with $test1\n"; fi
if [[ $test2 =~ *.fa|*.fasta|*.fasta.gz ]] &> /dev/null; then printf "Attempt1: Match with $test2\n"; fi
if [[ $test3 =~ *.fa|*.fasta|*.fasta.gz ]] &> /dev/null; then printf "Attempt1: Match with $test3\n"; fi

# Attempt 2 - do I need to quote the string?
if [[ "$test1" =~ *.fa|*.fasta|*.fasta.gz ]] &> /dev/null; then printf "Attempt2: Match with $test1\n"; fi
if [[ "$test2" =~ *.fa|*.fasta|*.fasta.gz ]] &> /dev/null; then printf "Attempt2: Match with $test2\n"; fi
if [[ "$test3" =~ *.fa|*.fasta|*.fasta.gz ]] &> /dev/null; then printf "Attempt2: Match with $test3\n"; fi

# Attempt 3 - alternative regex
if [[ $test1 =~ .\*.(fa|fasta|fasta.gz) ]] &> /dev/null; then printf "Attempt3: Match with $test1\n"; fi
if [[ $test2 =~ .\*.(fa|fasta|fasta.gz) ]] &> /dev/null; then printf "Attempt3: Match with $test2\n"; fi
if [[ $test3 =~ .\*.(fa|fasta|fasta.gz) ]] &> /dev/null; then printf "Attempt3: Match with $test3\n"; fi

# Attempt 4 - again with the quoted string
if [[ "$test1" =~ .\*.(fa|fasta|fasta.gz) ]] &> /dev/null; then printf "Attempt4: Match with $test1\n"; fi
if [[ "$test2" =~ .\*.(fa|fasta|fasta.gz) ]] &> /dev/null; then printf "Attempt4: Match with $test2\n"; fi
if [[ "$test3" =~ .\*.(fa|fasta|fasta.gz) ]] &> /dev/null; then printf "Attempt4: Match with $test3\n"; fi

# Attempt 5 - put $ on end of regex
if [[ $test1 =~ .\*.(fa|fasta|fasta.gz)$ ]] &> /dev/null; then printf "Attempt5: Match with $test1\n"; fi
if [[ $test2 =~ .\*.(fa|fasta|fasta.gz)$ ]] &> /dev/null; then printf "Attempt5: Match with $test2\n"; fi
if [[ $test3 =~ .\*.(fa|fasta|fasta.gz)$ ]] &> /dev/null; then printf "Attempt5: Match with $test3\n"; fi

# Attempt 6 - again with the quoted string
if [[ "$test1" =~ .\*.(fa|fasta|fasta.gz)$ ]] &> /dev/null; then printf "Attempt6: Match with $test1\n"; fi
if [[ "$test2" =~ .\*.(fa|fasta|fasta.gz)$ ]] &> /dev/null; then printf "Attempt6: Match with $test2\n"; fi
if [[ "$test3" =~ .\*.(fa|fasta|fasta.gz)$ ]] &> /dev/null; then printf "Attempt6: Match with $test3\n"; fi

# Attempt 7 - use double ||
if [[ $test1 =~ .\*.(fa||fasta||fasta.gz) ]] &> /dev/null; then printf "Attempt7: Match with $test1\n"; fi
if [[ $test2 =~ .\*.(fa||fasta||fasta.gz) ]] &> /dev/null; then printf "Attempt7: Match with $test2\n"; fi
if [[ $test3 =~ .\*.(fa||fasta||fasta.gz) ]] &> /dev/null; then printf "Attempt7: Match with $test3\n"; fi

Я близок к этому:

# Attempt 8 - escape parentheses
if [[ $test1 =~ .\*.\(fa|fasta|fasta.gz\) ]] &> /dev/null; then printf "Attempt8: Match with $test1\n"; fi
if [[ $test2 =~ .\*.\(fa|fasta|fasta.gz\) ]] &> /dev/null; then printf "Attempt8: Match with $test2\n"; fi
if [[ $test3 =~ .\*.\(fa|fasta|fasta.gz\) ]] &> /dev/null; then printf "Attempt8: Match with $test3\n"; fi

Однако первый тест не работает, и вывод выглядит следующим образом:

test1: abcdef.fa
test2: ghijkl.fasta
test3: mnopqr.fasta.gz
Attempt8: Match with ghijkl.fasta
Attempt8: Match with mnopqr.fasta.gz

Что мне не хватает?

Стоит ли изучать PHP в 2026-2027 годах?
Стоит ли изучать PHP в 2026-2027 годах?
Привет всем, сегодня я хочу высказать свои соображения по поводу вопроса, который я уже много раз получал в своем сообществе: "Стоит ли изучать PHP в...
Поведение ключевого слова "this" в стрелочной функции в сравнении с нормальной функцией
Поведение ключевого слова "this" в стрелочной функции в сравнении с нормальной функцией
В JavaScript одним из самых запутанных понятий является поведение ключевого слова "this" в стрелочной и обычной функциях.
Приемы CSS-макетирования - floats и Flexbox
Приемы CSS-макетирования - floats и Flexbox
Здравствуйте, друзья-студенты! Готовы совершенствовать свои навыки веб-дизайна? Сегодня в нашем путешествии мы рассмотрим приемы CSS-верстки - в...
Тестирование функциональных ngrx-эффектов в Angular 16 с помощью Jest
В системе управления состояниями ngrx, совместимой с Angular 16, появились функциональные эффекты. Это здорово и делает код определенно легче для...
Концепция локализации и ее применение в приложениях React ⚡️
Концепция локализации и ее применение в приложениях React ⚡️
Локализация - это процесс адаптации приложения к различным языкам и культурным требованиям. Это позволяет пользователям получить опыт, соответствующий...
Пользовательский скаляр GraphQL
Пользовательский скаляр GraphQL
Листовые узлы системы типов GraphQL называются скалярами. Достигнув скалярного типа, невозможно спуститься дальше по иерархии типов. Скалярный тип...
1
0
74
4
Перейти к ответу Данный вопрос помечен как решенный

Ответы 4

Ответ принят как подходящий

=~ должен принимать шаблоны регулярных выражений, а не шаблоны глобусов. Попробуйте \.(fa|fasta|fasta\.gz)$.

Также вы можете использовать расширенное сопоставление с образцом: [[ $test1 == *.@(fa|fasta|fasta.gz) ]]

Вместо \.(fa|fasta|fasta\.gz)$ я бы предпочел \.fa(sta(\.gz)?)?$, если это возможно.

gildux 05.02.2023 05:12

@gildux Действительно заманчиво объединить все общие компоненты в шаблон, но на самом деле это не делает его лучше для чего-то такого простого, как этот.

konsolebox 05.02.2023 05:44

Это зависит от того, как закодирован механизм регулярных выражений (и я не знаю для bash, поэтому мои последние слова) и как выполняется слияние. Я думаю о выступлениях… Но это не очевидная тема. :)

gildux 05.02.2023 16:14

Гораздо проще определить регулярное выражение в переменной:

#!/usr/bin/env bash

test1 = "abcdef.fa"
test2 = "ghijkl.fasta"
test3 = "mnopqr.fasta.gz"
echo "test1: $test1"
echo "test2: $test2"
echo "test3: $test3"

pattern='\.(fa|fasta|fasta.gz)$'
# Attempt 1
if [[ $test1 =~ $pattern ]] &> /dev/null; then printf "Attempt1: Match with $test1\n"; fi
if [[ $test2 =~ $pattern ]] &> /dev/null; then printf "Attempt1: Match with $test2\n"; fi
if [[ $test3 =~ $pattern ]] &> /dev/null; then printf "Attempt1: Match with $test3\n"; fi

Вы можете попробовать оператор case, например:

case "$test1" in
  *.fa|*.fasta|*.fasta.gz) printf 'Attempt1: Match with %s\n' "$test1";;
esac

case "$test2" in
  *.fa|*.fasta|*.fasta.gz) printf 'Attempt1: Match with %s\n' "$test2";;
esac

case "$test3" in
  *.fa|*.fasta|*.fasta.gz) printf 'Attempt1: Match with %s\n' "$test3";;
esac

  • Смотрите help case

  • Смотрите LESS='+/case word in' man bash

OP использует шаблон глобуса, поэтому подход с оператором case актуален. Проголосовать.

gildux 05.02.2023 05:08

Вы можете использовать либо сопоставление с регулярным выражением, либо сопоставление с образцом с помощью [[ ... ]].

# regular expression
[[ $test1 =~ \.(fa|fasta|fasta.gz)$ ]]

# pattern match
[[ $test1 = *.@(fa|fasta|fasta.gz) ]]

Регулярные выражения не привязаны ни к одному из концов строки, поэтому вам нужно сопоставить $, чтобы расширения действительно находились в конце строки, а не только где-то в середине. (...) — это список альтернатив на выбор

Совпадения с образцом привязаны к обоим концам, поэтому вам нужен *, чтобы сопоставить всю строку до расширения. @(...) — это список альтернатив на выбор.

В обоих случаях заключать в кавычки левый операнд необязательно.

Другие вопросы по теме