Shap & PyTorch Lightning — проблема с размером тензора

Я пытаюсь использовать shap для объяснения результатов модели Pytorch (Lightning). Вот код:

train_size = int(0.7 * len(dataset))
    val_size = int(0.1 * len(dataset))
    test_size = len(dataset) - train_size - val_size

    train_dataset, val_dataset, test_dataset = torch.utils.data.random_split(dataset,[train_size,val_size,test_size])

    train_dataloader = torch.utils.data.DataLoader(train_dataset, batch_size=256, shuffle=True)
    val_dataloader = torch.utils.data.DataLoader(val_dataset, batch_size=256, shuffle=True)
    test_dataloader = torch.utils.data.DataLoader(test_dataset, batch_size=256, shuffle=True)

    model = Model.load_from_checkpoint("path")

    batch = next(iter(test_dataloader))
    x, _, _ = batch

    background = x[:100].to(model.device)
    test_points = x[100:180].to(model.device)

    # model(test_points) PLEASE NOTE THAT THIS LINE RUN WITH NO WARNING/ERROR

    e = shap.DeepExplainer(model, background)
    shap_values = e.shap_values(test_points)

последняя строка кода вызывает следующую ошибку:

Traceback (most recent call last):
  File "shap_computation.py", line 40, in <module>
    main()
  File "shap_computation.py", line 35, in main
    shap_values = e.shap_values(test_points)
  File "virtualenv/lib/python3.9/site-packages/shap/explainers/_deep/__init__.py", line 124, in shap_values
    return self.explainer.shap_values(X, ranked_outputs, output_rank_order, check_additivity=check_additivity)
  File "virtualenv/lib/python3.9/site-packages/shap/explainers/_deep/deep_pytorch.py", line 185, in shap_values
    sample_phis = self.gradient(feature_ind, joint_x)
  File "virtualenv/lib/python3.9/site-packages/shap/explainers/_deep/deep_pytorch.py", line 121, in gradient
    grad = torch.autograd.grad(selected, x,
  File "virtualenv/lib/python3.9/site-packages/torch/autograd/__init__.py", line 300, in grad
    return Variable._execution_engine.run_backward(  # Calls into the C++ engine to run the backward pass
  File "virtualenv/lib/python3.9/site-packages/torch/nn/modules/module.py", line 62, in __call__
    return self.hook(module, *args, **kwargs)
  File "virtualenv/lib/python3.9/site-packages/shap/explainers/_deep/deep_pytorch.py", line 226, in deeplift_grad
    return op_handler[module_type](module, grad_input, grad_output)
  File "virtualenv/lib/python3.9/site-packages/shap/explainers/_deep/deep_pytorch.py", line 358, in nonlinear_1d
    grad_output[0] * (delta_out / delta_in).repeat(dup0))
RuntimeError: The size of tensor a (50) must match the size of tensor b (25) at non-singleton dimension 1

есть ли кто-нибудь, кто может помочь?

Почему в Python есть оператор "pass"?
Почему в Python есть оператор "pass"?
Оператор pass в Python - это простая концепция, которую могут быстро освоить даже новички без опыта программирования.
Некоторые методы, о которых вы не знали, что они существуют в Python
Некоторые методы, о которых вы не знали, что они существуют в Python
Python - самый известный и самый простой в изучении язык в наши дни. Имея широкий спектр применения в области машинного обучения, Data Science,...
Основы Python Часть I
Основы Python Часть I
Вы когда-нибудь задумывались, почему в программах на Python вы видите приведенный ниже код?
LeetCode - 1579. Удаление максимального числа ребер для сохранения полной проходимости графа
LeetCode - 1579. Удаление максимального числа ребер для сохранения полной проходимости графа
Алиса и Боб имеют неориентированный граф из n узлов и трех типов ребер:
Оптимизация кода с помощью тернарного оператора Python
Оптимизация кода с помощью тернарного оператора Python
И последнее, что мы хотели бы показать вам, прежде чем двигаться дальше, это
Советы по эффективной веб-разработке с помощью Python
Советы по эффективной веб-разработке с помощью Python
Как веб-разработчик, Python может стать мощным инструментом для создания эффективных и масштабируемых веб-приложений.
0
0
76
1
Перейти к ответу Данный вопрос помечен как решенный

Ответы 1

Ответ принят как подходящий

Первоначальная модель была чем-то вроде

fc1 = nn.Linear(...) 
fc2 = nn.Linear(...)

и так далее. Вдохновленный обсуждением на GitHub, я узнал об этом, изменив модель с помощью nn.Sequential. Код, размещенный в вопросе, работает без проблем

Другие вопросы по теме