Сохраните и загрузите модель LightGBM в R

Я пытаюсь сохранить, а затем загрузить модель LightGBM, но не могу этого сделать. Я уже пробовал функции saveRDS() и readRDS, но когда я прогнозирую, я получаю эту ошибку:

Ошибка в предикторе $predict(data = data, start_iteration = start_iteration, : Попытка использовать бустер, который больше не существует. Это может произойти, если вы вызвали Booster$finalize() или если этот бустер был сохранен с помощью saveRDS(). Чтобы избежать этой ошибки в в будущем используйте saveRDS.lgb.Booster() или Booster$save_model() для сохранения. Усилители LightGBM.

Если я использую модель сразу после ее обучения или в сеансе, когда она загружается в рабочую область, она работает нормально. Проблема в том, что я пытаюсь использовать модель в другом приложении. Вот как я это закодировал:

library(tidymodels)
library(lightgbm)
library(bonsai)

TMA_model <- data.frame(
  age = c(50, 45, 60, 55, 70, 34, 55, 48, 58, 42,
          52, 47, 62, 57, 72, 36, 53, 49, 59, 44,
          51, 46, 61, 56, 71, 35, 54, 50, 60, 43), 
  delta_creat = c(1.2, 1.0, 1.5, 1.3, 1.8, 1.2, 1.3, 1.4, 1.1, 1.6,
                  1.2, 1.0, 1.5, 1.3, 1.8, 1.2, 1.3, 1.4, 1.1, 1.6,
                  1.2, 1.0, 1.5, 1.3, 1.8, 1.2, 1.3, 1.4, 1.1, 1.6), 
  max_LDH = c(300, 280, 320, 310, 330, 295, 325, 290, 315, 305,
              305, 315, 290, 320, 300, 325, 280, 330, 310, 295,
              310, 295, 330, 280, 320, 305, 310, 325, 315, 290), 
  min_plat = c(150, 140, 160, 155, 170, 145, 165, 150, 135, 160,
               160, 155, 170, 145, 150, 160, 140, 170, 155, 145,
               155, 145, 170, 140, 160, 150, 155, 160, 165, 135),
  min_hb = c(12, 11.5, 13, 12.5, 14, 11.8, 13.2, 12.2, 12.6, 11.9,
             12.4, 11.7, 13.1, 12.3, 13.5, 11.6, 12.8, 12.1, 13.4, 12.0,
             12.9, 11.6, 13.2, 12.8, 13.0, 11.5, 12.7, 12.3, 12.5, 11.8), 
  max_ast = c(40, 38, 42, 41, 45, 37, 43, 39, 44, 40,
              42, 38, 44, 41, 40, 39, 43, 38, 45, 37,
              44, 37, 42, 38, 41, 40, 43, 39, 44, 38), 
  max_bt = c(37, 37.2, 37.5, 37.3, 37.8, 37.1, 37.4, 37.6, 37.0, 37.7,
             37.2, 37.1, 37.5, 37.4, 37.3, 37.0, 37.6, 37.8, 37.2, 37.4,
             37.7, 37.1, 37.3, 37.8, 37.0, 37.4, 37.2, 37.6, 37.5, 37.1), 
  max_ttap = c(100, 95, 105, 102, 110, 97, 108, 93, 103, 98,
               105, 100, 95, 110, 102, 108, 97, 93, 103, 95,
               100, 97, 105, 93, 108, 102, 110, 98, 103, 100), 
  max_tp = c(12, 12.2, 12.5, 12.3, 12.8, 12.1, 12.4, 12.6, 12.0, 12.7,
             12.3, 12.2, 12.1, 12.8, 12.4, 12.0, 12.6, 12.7, 12.5, 12.3,
             12.1, 12.4, 12.7, 12.8, 12.0, 12.2, 12.3, 12.6, 12.5, 12.4), 
  hypertension = c(1, 0, 1, 1, 0, 0, 1, 0, 1, 0,
                   1, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 1, 1, 0,
                   0, 1, 0, 1, 0, 0, 1, 1, 0, 1),  
  MAP = c(90, 92, 88, 91, 89, 93, 87, 94, 86, 90,
          92, 94, 88, 90, 91, 89, 87, 93, 86, 92,
          91, 90, 93, 94, 86, 88, 89, 87, 92, 91),  
  TMA_class = factor(c(1, 2, 3, 4, 5, 1, 2, 3, 4, 5,
                       1, 2, 3, 4, 5, 1, 2, 3, 4, 5,
                       1, 2, 3, 4, 5, 1, 2, 3, 4, 5))
)

new_data <- data.frame(
  age = c(48, 55, 62, 54, 67),  
  delta_creat = c(1.2, 1.3, 1.1, 1.4, 1.6),  
  max_LDH = c(305, 290, 320, 310, 295),  
  min_plat = c(150, 160, 135, 155, 145),  
  min_hb = c(12.2, 12.6, 11.9, 12.4, 11.7),  
  max_ast = c(38, 43, 39, 44, 40),  
  max_bt = c(37.2, 37.4, 37.0, 37.6, 37.1),  
  max_ttap = c(95, 108, 93, 103, 98),  
  max_tp = c(12.2, 12.4, 12.0, 12.6, 12.7),  
  hypertension = c(1, 0, 1, 0, 1),  
  MAP = c(92, 87, 94, 86, 90)  
)

model_spec <- 
  boost_tree(mode = 'classification',
             mtry = 6,  
             trees = 50, 
             min_n = 50,  
             tree_depth = 5) %>%
  set_engine('lightgbm')

recipe <- recipe(TMA_class ~ ., data = TMA_model)

model_fit <- workflow() %>%
  add_recipe(recipe) %>%
  add_model(model_spec) %>%
  fit(data = TMA_model)

saveRDS(model_fit, "model_fit.rds")
model_b <- readRDS("model_fit.rds")

new_data_predictions <- predict(model_b, new_data)

print(new_data_predictions)

У меня не было ошибок при сохранении или загрузке, но я не могу прогнозировать с загруженной моделью. Кроме того, у меня нет проблем с другими моделями, такими как lasso или xgboost, они работают нормально, а LightGBM - нет.

Ваш код не воспроизводим. Посетите Как сделать отличный воспроизводимый пример R. Предоставьте пакеты, которые вы использовали, с данными в формате dput(). Вы тоже не определили TMA_model.

UseR10085 25.09.2023 08:53

сделал воспроизводимый код, который имеет ту же проблему. если я использую «model_fit» для прогнозирования, он работает нормально, но если я использую model_b (сохраненная версия model_fit), он не работает.

Abner Mácola 26.09.2023 03:50
Стоит ли изучать PHP в 2026-2027 годах?
Стоит ли изучать PHP в 2026-2027 годах?
Привет всем, сегодня я хочу высказать свои соображения по поводу вопроса, который я уже много раз получал в своем сообществе: "Стоит ли изучать PHP в...
Поведение ключевого слова "this" в стрелочной функции в сравнении с нормальной функцией
Поведение ключевого слова "this" в стрелочной функции в сравнении с нормальной функцией
В JavaScript одним из самых запутанных понятий является поведение ключевого слова "this" в стрелочной и обычной функциях.
Приемы CSS-макетирования - floats и Flexbox
Приемы CSS-макетирования - floats и Flexbox
Здравствуйте, друзья-студенты! Готовы совершенствовать свои навыки веб-дизайна? Сегодня в нашем путешествии мы рассмотрим приемы CSS-верстки - в...
Тестирование функциональных ngrx-эффектов в Angular 16 с помощью Jest
В системе управления состояниями ngrx, совместимой с Angular 16, появились функциональные эффекты. Это здорово и делает код определенно легче для...
Концепция локализации и ее применение в приложениях React ⚡️
Концепция локализации и ее применение в приложениях React ⚡️
Локализация - это процесс адаптации приложения к различным языкам и культурным требованиям. Это позволяет пользователям получить опыт, соответствующий...
Пользовательский скаляр GraphQL
Пользовательский скаляр GraphQL
Листовые узлы системы типов GraphQL называются скалярами. Достигнув скалярного типа, невозможно спуститься дальше по иерархии типов. Скалярный тип...
0
2
71
1
Перейти к ответу Данный вопрос помечен как решенный

Ответы 1

Ответ принят как подходящий

Вам необходимо использовать версию lightgbm для разработки, чтобы сохранить и загрузить модель с помощью saveRDS()/readRDS() как обычно, как сообщается здесь. Но установить разрабатываемую версию lightgbm не так уж и просто. Вам необходимо выполнить следующие шаги в Windows, чтобы установить версию для разработки lightgbm

Установка из исходного кода с помощью CMake

Вам необходимо установить git и CMake первую форму https://git-scm.com/downloads и https://cmake.org/download/

Примечание. Этот метод поддерживается только в 64-битных системах. Если вам нужно запустить LightGBM в 32-разрядной версии Windows (i386), следуйте инструкциям в разделе «Установка пакета CRAN».

Подготовка Windows

ПРИМЕЧАНИЕ. Пользователям Windows может потребоваться запуск с правами администратора (либо R, либо командная строка, в зависимости от способа установки этого пакета).

Установка 64-битной версии Rtools обязательна. После установки Rtools и CMake убедитесь, что в переменную среды PATH добавлены следующие пути.

• Rtools: если у вас есть Rtools 4.3, пример:

C:\rtools43\mingw64\bin

C:\rtools43\usr\bin

• Пример CMake:

C:\Program Files\CMake\bin

• Пример R:

C:\Program Files\R\R-4.3.1\bin

Установите MSYS2 (R 4.x)

Установите MSYS2 с https://www.msys2.org/

Установить Пандок

Загрузите Pandoc с https://pandoc.org/installing.html и установите его.

В Windows вы можете использовать либо классическую командную строку, либо более современный терминал PowerShell. Если вы используете Windows в режиме рабочего стола, запустите команду cmd или powershell из меню «Пуск» и введите chcp 65001 перед использованием pandoc, чтобы установить кодировку UTF-8. Давайте проверим, что pandoc установлен. Тип

pandoc --version

и нажмите Enter. Вы должны увидеть сообщение о том, какая версия pandoc установлена, и дополнительную информацию.

Установить с помощью CMake

После выполнения описанных выше шагов «подготовки» для вашей операционной системы соберите и установите R-пакет, выполнив следующие команды в командной строке, запущенной с правами администратора:

git clone --recursive https://github.com/microsoft/LightGBM
cd LightGBM
Rscript build_r.R --use-msys2

После этого ваш код запускается без ошибок. Мне потребовался целый день, чтобы понять, как установить разрабатываемую версию lightgbm.

Друг мой, извини, что мне потребовалось немного больше времени, чем ожидалось, но я наконец все сделал. Я потерял много дней, пытаясь это исправить, так что большое спасибо!

Abner Mácola 28.09.2023 01:57

Другие вопросы по теме