Я установил исходный код Github Pages на myRepo/docs.
В /docs есть удобный README.md и index.html, который является частью scaladoc.
Я хочу, чтобы целевой страницей был README.md, но в настоящее время по умолчанию используется index.html.
Могу я это изменить?

По умолчанию страницы github работают по поиску index.html, если его там нет, он переходит в README.md.
Вам нужно удалить index.html из ветки gh-pages и оставить там только README.md
Хорошо, спасибо, я реорганизую свой скаляр в подкаталог.