Вложенный синтаксический анализ XML с использованием Xerces DOMParser в java

Вы повторяете неправильный узел ... у вас несколько тегов req: message, а не req: messages ... надеюсь, вы понимаете ... пожалуйста, проверьте этот код

Здесь вы можете напрямую получить элементы req: message и повторить их ..

    private static String parseXmlData() throws ParserConfigurationException, SAXException, IOException {
        String str = "<?xml version=\"1.0\" encoding=\"UTF-8\"?><req:messages xmlns:req=\"http://hp.com/ecc/request/\"><req:message category=\"GENERIC\" type=\"error\" number=\"6\">Null pointer exception occured.</req:message><req:message category=\"GENERIC\" type=\"error\" number=\"6\">Arithmetic exception occured.</req:message><req:message category=\"GENERIC\" type=\"error\" number=\"6\">Class not found exception occured.</req:message></req:messages>";
        DocumentBuilder db = DocumentBuilderFactory.newInstance().newDocumentBuilder();
        InputSource is = new InputSource();
        is.setCharacterStream(new StringReader(str));
        Document doc = db.parse(is);
        NodeList nodes = doc.getElementsByTagName("req:message");
        StringBuilder sb = new StringBuilder();        
        for (int i = 0; i < nodes.getLength(); i++) {
          Element element = (Element) nodes.item(i);
          sb.append(getCharacterDataFromElement(element) + System.lineSeparator());
        }
        return sb.toString();
    }

или Если вам нужны только элементы req: message в тегах req: messages, используйте этот код ...

private static String parseXmlData() throws ParserConfigurationException, SAXException, IOException {
    String str = "<?xml version=\"1.0\" encoding=\"UTF-8\"?><req:messages xmlns:req=\"http://hp.com/ecc/request/\"><req:message category=\"GENERIC\" type=\"error\" number=\"6\">Null pointer exception occured.</req:message><req:message category=\"GENERIC\" type=\"error\" number=\"6\">Arithmetic exception occured.</req:message><req:message category=\"GENERIC\" type=\"error\" number=\"6\">Class not found exception occured.</req:message></req:messages>";
    DocumentBuilder db = DocumentBuilderFactory.newInstance().newDocumentBuilder();
    InputSource is = new InputSource();
    is.setCharacterStream(new StringReader(str));
    Document doc = db.parse(is);
    NodeList nodes = doc.getElementsByTagName("req:messages");
    StringBuilder sb = new StringBuilder();
    for (int i = 0; i < nodes.getLength(); i++) {
      Element element = (Element) nodes.item(i);
      NodeList names = element.getElementsByTagName("req:message");
      for (int j = 0; j < names.getLength(); j++) {
          Element line = (Element) names.item(j);
          sb.append(getCharacterDataFromElement(line) + System.lineSeparator());
      }
    }
    return sb.toString();
}