Вставка комментария в файл Docx * вокруг * текста внутри прогона

Вы должны разбить его на отдельные серии. Попробуйте использовать DocumentReflector - он даже генерирует код C# - чтобы просмотреть документ, созданный с помощью word. Структура должна выглядеть примерно так (упрощенно):

<paragraph>
  <run>...</run>
  <commentRangeStart />
  <run>search text</run>
  <commentRangeEnd />
  <run>...</run>
</paragraph>

Для тех, кто все еще ищет ответ:

Здесь - это код для этого:

private void AddComment( Paragraph paragraph, string text )
        {
            string commentId = GetNextCommentId();
            Comment comment = new Comment() { Id= commentId, Date = DateTime.Now };
            Paragraph commentPara = new Paragraph( new Run( new Text( GetCommentsString( text ) ) ) { RunProperties = new RunProperties( new RunStyle() { Val = "CommentReference" } ) } );
            commentPara.ParagraphProperties = new ParagraphProperties( new ParagraphStyleId() { Val = "CommentText" } );
            comment.AppendChild( commentPara );
            _comments.AppendChild( comment );//Comments object
            _comments.Save();

            paragraph.InsertBefore( new CommentRangeStart() { Id = commentId }, paragraph.GetFirstChild<Run>() );
            var commentEnd = paragraph.InsertAfter( new CommentRangeEnd() { Id = commentId }, paragraph.Elements<Run>().Last() );
            paragraph.InsertAfter( new Run( new CommentReference() { Id = commentId } ), commentEnd );
        }