Если ! mkdir -p $ КАТАЛОГ_ПРИЛОЖЕНИЙ / conf

mkdir -p "$APPLICATION_DIRECTORY/conf" пытается создать указанный каталог, попутно создавая все отсутствующие родительские каталоги. Как и любая команда, она имеет целочисленный статус выхода, где 0 указывает, что каталог был успешно создан, а ненулевое значение указывает на ошибку какого-либо рода.

Команда if проверяет статус выхода своей команды, а не логическое значение, как в большинстве других языков программирования. Оператор ! отменяет статус выхода: ненулевой статус выхода преобразуется в 0, а статус выхода 0 преобразуется в 1.

Другими словами,

if ! mkdir -p "$APPLICATION_DIRECTORY/conf"; then
  echo "There was an error creating the directory"
else
  echo "The directory was successfully created"
fi

Также можно использовать прямую логику (более понятную): если mkdir -p ...

пример :

if mkdir -p "$APPLICATION_DIRECTORY/conf"; then 
   echo "The directory was successfully created"
else 
   echo "There was an error creating the directory"
fi