Есть ли эквивалент Ctrl-Shift-R в Safari / WebKit?

Safari всегда перезагружает (ctrl + r) страницу игнорируя все, что может быть в кеше.

Как указывает Афина, фреймы кешируются. На самом деле это не содержимое iframe, а кэшируется запрос.

In those cases, Safari caches the page, and then no matter which link you click, shows the iframe from the last click BEFORE the refresh (or back/forward). It's then stuck on that content, and shows it for all links.

Это преодолевается назначением другой идентификатор iframe при каждой загрузке:

iframe.id = new Date().getTime();