Замените все «+» на «% 20» с помощью Javascript

Вам просто нужно сначала экранировать +, что делается с помощью обратной косой черты:

const str = "123+456+789";
console.info(
  str.replace(/\+/g, '%20')
);

То же самое верно для любого символа со специальным значением в регулярном выражении, такого как круглые скобки, *, ^ и т. д. - чтобы соответствовать символу буквальный, поставьте перед ним обратную косую черту. (То же самое для самой обратной косой черты - \\ соответствует буквальной обратной косой черте)

Вы можете использовать String#split() и Array#join(), чтобы удалить все плюсы и заменить их на %20:

let plus = "123+456+789";

let percent = plus.split("+").join("%20");

console.info(percent)

Вы можете добиться этого, используя str replace

str = document.getElementById("mystring").innerHTML;
res = str.replace("+", "%20");