Как мне использовать конструктор узлов из Scriptacolus для вставки html

Последним параметром Builder.node является «Массив, список других узлов, которые будут добавлены в качестве дочерних» в соответствии с Вики. Поэтому, когда вы передаете ему строку, она обрабатывается как текст.

Вы можете использовать:

var a = Builder.node('div').update("<a href='#'>foo</a>")

Где ссылка текстовая или:

var a = Builder.node('div', {'class':'cool'}, 
         [Builder.node('div', {'class': 'another_div'})]
        );

И вы можете использовать только Prototypes новый элемент () (Доступно с версии 1.6).

var a = new Element('div').insert(
          new Element('div', {'class': 'inner_div'}).update("Text in the inner div")
        );

Вы можете использовать это решение: http://sviudes.blogspot.com/2009/08/como-usar-etiquetas-html-con.html