Сегментация трехмерного изображения Python находит локальные пики на карте расстояний для водораздела

Я пытаюсь сегментировать трехмерные томографы пористых сетей на Python. Я могу рассчитать карту расстояний с помощью ndimage.distance_transform_edt и пиков с помощью feature.peak_local_max. когда я применяю алгоритм водораздела, я получаю приемлемый результат, но маркеры пиков не расположены на видимых пиках, см. изображение карты расстояний

заранее спасибо

Здесь код a - изображение

D = ndimage.distance_transform_edt(a)
localMax = feature.peak_local_max(D, indices=False, min_distance=50,
            labels=a)
localMax2 = feature.peak_local_max(D, indices=True, min_distance=50,
            labels=a)

markers = ndimage.label(localMax, structure=np.ones((3,3,3)))[0]
labels = morphology.watershed(-D,markers,mask=a)

В чем вопрос? Также укажите свой код, см. минимальный воспроизводимый пример.

— 14.08.2018 21:14

есть ли другой вариант для расчета локальных минимумов для трехмерных массивов?

— 14.08.2018 21:38

(а) как упомянул Крис, предоставьте полный пример кода; но (б) да, см. skimage.morphology.local_maxima, который является рекомендуемым способом их вычисления, если вам не нужны причудливые функции min_distancepeak_local_max.

— 15.08.2018 02:32

python-3.x opencv image-processing scipy scikit-image

14.08.2018 19:42

Стоит ли изучать PHP в 2026-2027 годах?

Привет всем, сегодня я хочу высказать свои соображения по поводу вопроса, который я уже много раз получал в своем сообществе: "Стоит ли изучать PHP в...

Поведение ключевого слова "this" в стрелочной функции в сравнении с нормальной функцией

В JavaScript одним из самых запутанных понятий является поведение ключевого слова "this" в стрелочной и обычной функциях.

Приемы CSS-макетирования - floats и Flexbox

Здравствуйте, друзья-студенты! Готовы совершенствовать свои навыки веб-дизайна? Сегодня в нашем путешествии мы рассмотрим приемы CSS-верстки - в...

Тестирование функциональных ngrx-эффектов в Angular 16 с помощью Jest

В системе управления состояниями ngrx, совместимой с Angular 16, появились функциональные эффекты. Это здорово и делает код определенно легче для...

Концепция локализации и ее применение в приложениях React ⚡️

Локализация - это процесс адаптации приложения к различным языкам и культурным требованиям. Это позволяет пользователям получить опыт, соответствующий...

Пользовательский скаляр GraphQL

Листовые узлы системы типов GraphQL называются скалярами. Достигнув скалярного типа, невозможно спуститься дальше по иерархии типов. Скалярный тип...

2 325

Ответы 1

Я нашел путь:

мне пришлось исключить границы и применить порог

     D = ndimage.distance_transform_edt(a)

    localMax = feature.peak_local_max(D, indices=False, min_distance=30,
        labels=a,threshold_abs=9,exclude_border=1)
    localMax2 = feature.peak_local_max(D, indices=True, min_distance=30,
        labels=a,threshold_abs=9,exclude_border=1)

    #markers = ndimage.label(localMax, structure=np.ones((3,3,3)))[0]
    markers = ndimage.label(localMax, structure=np.ones((3,3,3)))[0]
    labels = morphology.watershed(-D,markers,mask=a)
    regions=measure.regionprops(labels,intensity_image=a)

16.08.2018 15:02

Другие вопросы по теме

Поиск ярких пятен на изображении с помощью opencv

Open CV Каскадное обучение Хаара невозможно обучить

Получите все пиксели, отличные от одного цвета, и раскрасьте их на другом изображении

Java / OpenCV - Как сделать запись видео h264 без потерь в openCV?

Как преобразовать vtkImageData в cv :: Mat?

Распознавание лиц Python медленное

Как получить 3D-координаты из файла 3D-объекта

Как сохранить классификатор openCV?

Файл .vec Opencv Create Samples не был создан

Сегментирование товаров на полке

Сегментация трехмерного изображения Python находит локальные пики на карте расстояний для водораздела

Ответы 1

Другие вопросы по теме

Похожие вопросы