SetEvent атомарен?

Предполагая, что у вас есть несколько потоков, ожидающих одного и того же события, выполняющих один и тот же код.

1. Если ваш код не очищает событие до тех пор, пока оно не будет обработано, у вас фактически есть CS. Поскольку событие остается сигнализируемым до тех пор, пока оно не будет очищено (иначе говоря, не сбрасывается автоматически), наличие нескольких потоков сигнализирует, что ничего не делает, кроме вращения процессора.
2. Если ваш код очищает его в начале обработки или событие автоматически устанавливается, тогда у вас будет несколько потоков, выполняющих одну и ту же функцию, что небезопасно, если эти потоки что-то совместно используют.

нет ограничений на вызов SetEvent из нескольких потоков.

Это безопасно, но помните, что если один поток устанавливает его, а другой поток устанавливает его одновременно, вы не получите два уведомления, а только одно; поскольку второй изменил его с True на ... True. Если вас это беспокоит, используйте вместо этого семафоры.