Я пытаюсь загрузить приложение в ArgoCD, и для изображений, хранящихся в реестре, все нормально; но можно ли применить Dockerfile к образу перед его развертыванием, сообщив об этом ArgoCD через приложение helm chart/yaml?
В документации ArgoCD кажется, что это возможно: https://argo-cd.readthedocs.io/en/stable/operator-manual/custom_tools/#byoi-build-your-own-image





Нет, это невозможно. ArgoCD не будет создавать образы самостоятельно, это не входит в его обязанности.
Вы должны создать образы и опубликовать их где-нибудь, чтобы развернуть их через ArgoCD. Как и без ArgoCD: Kubernetes не будет создавать образы, их нужно откуда-то тянуть.
Ссылка, на которую вы ссылаетесь, предназначена для создания пользовательского образа ArgoCD.