Визуализация данных графиков
Мне нужно визуализировать графики, где каждая пара узлов, соединенных запятой, представляет ребро, а числовое значение представляет интенсивность этого ребра. Например, ('A', 'B'): 0,71 означает, что узел A соединен с узлом B с интенсивностью края 0,71. Теперь мне нужно визуализировать эти графики в Python. Вот данные графиков.
График 1
('A', 'B'): 0.71
('M', 'B'): 0.67
('N', 'B'): 0.64
('A', 'O'): 0.62
('O', 'B'): 0.60
('N', 'O'): 0.53
('M', 'O'): 0.46
('A', 'N'): 0.18
('M', 'N'): 0.11
График 2
('ABC', 'ADC'): 0.53
График 3
('CDE', 'CFH'): 0.28
График 4
('GHI', 'GMI'): 0.20
График5
('XYZ', 'XWZ'): 0.17
Может ли кто-нибудь помочь мне наглядно представить эти графики?
Я протестировал ваш код и столкнулся с той же проблемой перекрытия узлов, что и в моем собственном коде. Для справки я прикрепил выходное изображение, созданное вашим кодом. Для сохранения файла я использовал следующую команду: plt.savefig('graph_image.png')
Ответы 1
Просто используйте networkx:
import matplotlib.pyplot as plt
import networkx as nx
data = {
('A', 'B'): 0.71,
('M', 'B'): 0.67,
('N', 'B'): 0.64,
('A', 'O'): 0.62,
('O', 'B'): 0.60,
('N', 'O'): 0.53,
('M', 'O'): 0.46,
('A', 'N'): 0.18,
('M', 'N'): 0.11
}
Создайте график из вашего набора данных:
G = nx.Graph()
for key, value in data.items():
G.add_edge(*key, weight=value)
И визуализируйте компоненты по своему желанию:
fig, axe = plt.subplots()
pos = nx.spring_layout(G, seed=123456)
nx.draw_networkx_nodes(G, pos, ax=axe)
nx.draw_networkx_edges(G, pos, ax=axe)
nx.draw_networkx_labels(G, pos, font_size=12, ax=axe)
nx.draw_networkx_edge_labels(G, pos, nx.get_edge_attributes(G, "weight"), ax=axe)
Обновлять
Чтобы управлять цветом края на основе веса, вы можете использовать следующий фрагмент:
fig, axe = plt.subplots()
pos = nx.spring_layout(G, seed=123456)
nx.draw_networkx_nodes(G, pos, ax=axe)
nx.draw_networkx_edges(G, pos, ax=axe, edge_color=data.values(), edge_cmap=plt.cm.jet)
nx.draw_networkx_labels(G, pos, font_size=12, ax=axe)
nx.draw_networkx_edge_labels(G, pos, nx.get_edge_attributes(G, "weight"), ax=axe)
nx.draw_networkx_edge_labels(G, pos, nx.get_edge_attributes(G, "weight"), ax=axe)
@jlandercy У меня возникла проблема с вашим кодом. Я обновил свой пост с подробностями проблемы. Не могли бы вы просмотреть его и посмотреть, сможете ли вы определить проблему?
Я добавил фрагмент для окраски края в зависимости от веса. Я не могу воспроизвести вашу проблему. Я подозреваю, что вы строите несколько графиков на одном рисунке. Явно укажите цифру и топор (обновленный фрагмент), чтобы избавиться от этой проблемы. Не стесняйтесь отмечать ответ как ответивший, если я обратился к вашему ФП.
Спасибо за дополнение. Во-первых, мне нужен только один цвет по краям, и край с высоким значением должен быть темнее, а край с меньшим значением должен быть светлее соответственно. Более того, я попробовал явно указать фигуру и топор, но получил ту же проблему.
Не стесняйтесь выбирать правильную карту цветов, которая вам удобна (matplotlib.org/stable/users/explain/colors/colormaps.html, например: plt.cmap.Blues). Как я уже сказал, мне не удалось воспроизвести вашу проблему, экспорт явно созданного fig отлично работает с последней версией Matplotlib и NetworkX. Без подробностей отладки я ничего не могу сделать с этой проблемой. Не забудьте принять ответ, если он адресован вашему ОП.
Спасибо, я приму ваш ответ, не волнуйтесь. Подскажите, пожалуйста, какие сведения об отладке мне следует предоставить?
@jlandercy, большое спасибо за ответ. Мне интересно, показываем ли мы края с интенсивностью цвета (высокое значение дает более темный цвет, а низкое значение - светлый) вместо его значений?