Как узнать, какой лимит памяти установлен в R?
Это связано с вопросом о том, как увеличить лимит памяти на macOS, «Ошибка R на MacOS: векторная память исчерпана (достигнут предел?)». Мне было интересно, есть ли какой-нибудь способ прочитать это значение в R, чтобы моя программа могла адаптироваться к верхней границе во время выполнения вместо того, чтобы сталкиваться с ошибкой ограничения памяти?
Я понимаю, что значение можно установить в файле .Renviron, но я не уверен, всегда ли этот файл находится в одном и том же месте или вообще требуется ли он во всех случаях...
Ответы 2
R_MAX_VSIZE — это переменная среды, поэтому вы можете получить к ней доступ с помощью Sys.getenv().
> Sys.getenv("R_MAX_VSIZE")
100Gb
Это также связано с вопросом R о доступе к переменным среды: «Как мне заставить R читать переменные среды?»
В документации по памяти в базе R о R_MAX_VSIZE говорится следующее.
Максимальный размер векторной кучи можно установить с помощью переменной окружения
R_MAX_VSIZE. Попытка установить более низкий максимум, чем текущее использование, игнорируется. Пределы векторной кучи указаны в байтах.
(выделено мной)
Однако, как обсуждалось в предыдущих ответах на StackOverflow (1 , 2), значение также может быть задано как 100Gb или 32Mb.
Это связано с тем, что переменная окружения передается в функцию R_Decode2Long (см. определение в исходном коде).
Вы можете адаптировать этот код для ручного анализа переменной среды или прочитать анализируемый предел, используя gc(), который смотрит на первый нечисловой символ, чтобы определить, следует ли умножать числовую часть на 1 или на различные степени 1024.
> gc()
used (Mb) gc trigger (Mb) limit (Mb) max used (Mb)
Ncells 1192165 63.7 2426177 129.6 NA 2426177 129.6
Vcells 2756215 21.1 8388608 64.0 102400 3597156 27.5
> gc()[10]
[1] 102400
> gc()[10] * 1024^2
[1] 107374182400
Проверьте пакет memuse. Он должен содержать всю необходимую вам информацию об использовании и свободной памяти.